revisa los cilindros (condensadores) de la placa base, puede que tengas alguno inchado o reventado (es decir, dañado).
como por probar no se pierde nada, podrias mirar de actualizar los controladores de sonido "a ver que pasa" o incluso probar con una distribución "live" de linux (para descartar problema de software mas que nada).
tambien podrias conseguir una tarjeta de sonido pci, que vale dos duros y en caso de fallo "fisico" de tu placa base (que afecte a la parte de sonido) seguramente te solucionen el problema.