La mejor forma de no perder información no es en muchos y pequeños, si no en la cantidad que quieras y por duplicado. Puedes tener la información en un disco de 4TB y tener esa información duplicada en otro de 4TB. Es más caro pero muchísimo más fiable, y creo que merece la pena. Es por esto por lo que se debe discernir y clasificar los datos por su importancia y sólo duplicar aquellos que verdaderamente te resulten cruciales bajo tu propio criterio; pues siempre será mejor y más barato tener 2 discos de 1TB para datos cruciales y otro de 4TB para otras cosas, que 2 discos de 4TB para respaldar todo o cientos de discos de 250 GB para minimizar daños.
Respecto a lo de el cambio de placa, es un tema mucho de prueba y error. Si te buscas un disco duro 100% idéntico al disco que ya tienes seguro que la placa va a funcionar, de otra manera es mirar si la controladora reconoce correctamente el hardware del disco y si es capaz de controlarlo o si tan siquiera puedes llegar a conectar la placa en los terminales de los que dispone. Realmente no va a implotar el disco porque le conectes una placa incompatible, tal vez suceda que no arranque el motor o que te des cuenta de que, simplemente por factor de forma, no puedas ni conectar la placa.