Exacto.
MySQL y SQLServer son motores de bases de datos (uno de Oracle, y gratis, creo. El segundo, de Microsoft)
Para trabajar con ellos, necesitas un IDE.
Para MySQL-> MySQL Workbench o PHPMYADMIN (por ejemplo)
Para SQLServer ->SQLServer Management Studio
Y como han dicho, SQL es un lenguaje independientemente del motor de base de datos que uses, y te servirá igual (salvo ligeras diferencias).
Saludos!