si has hecho una sustitucion completa como pone en ese tutorial, los originales no te funcionaran nunca.. ya lo dice el propio autor en la home:
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Got a quick little page on replacing the DVD drive in the XBOX with a Pioneer 500M. This is a full replacement and works with the XBOX eject button.
--------------->It doesn't read original XBOX games<--------------.
This is based off PSXBASE's German hack of a Toshiba and Acer DVD drive.
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el tema de los cdr no tengo muy claro pq puede ser, con un dvd 'retail' deberian funcionar sin problemas.
salu2