Depende de la version del HDL/HDA que tengas, los de 48bitsLBA manejan discos de hasta 2000GB -2TB-, logicamente no encontraras disocs de esta capacidad pero es el tamaño que en teoria puede manejar, siendo mas explicito, hay gente aqui y en otrso foros que dice manejar discos de 300 y 400GB sin mucho problema, aunque la verdad, ¿realmente ocuparas y necesitaras tanto espacio?, supongo que con uno de 60-80GB para juegos es ideal o de 120-200GB seria mas que suficiente si manejas tambien imagenes, audio y video con SMS o PS2Reality Media Player.
Sobre discos por USB, he manejado discos de 200GB y amigos dicen que de 300GB sin problema -despues de aplicar el parche a WinXP para discos grandes y tarjetas madre recientes-.