pues tira de metro, porque cada caja es diferente... no creo que ahí entren las HD5800 que vienen siendo 28 o 29cm (31cm la HD5970), difícil veo que las HD4800 o GTX200 que salen a unos 26-27cm... creo que lo más gordo que puedes meter sería una HD4770 así a ojo, pero vamos tira de metro y mide...
en cuanto a la placa, saber qué marca de CPU vas a montar ayudaría mucho... aunque en general, salvo que la gráfica que puedas meter sea gordorra, no creo que tengas problemas con el PCIe y el PCI...