El problema que tienes es que las halogenas van con corriente alterno (pueden ir con continua, pero dejandola alterna es mas barato, esto lo he aprendido por las malas este fin de semana
![partiéndose XD](/images/smilies/biggrin.gif)
), al fin y al cabo son bombillas, y los LEDS solo van con continua
Cuando varías la intensidad de las halógenas bajas el voltaje que les llega y estas, pues simplemente hacen menos luz.
Pero cuando tienes un circuito para LED el transformador tiene que pasar de alterna a continua y si le bajas el voltaje de entrada esa transformacion se va al garete.
Sin entrar en demasiadas explicaciones, hay un condensador que "inyecta" electricidad al circuito para hacerla constante (sino tendría altibajos), pero si le bajas el voltaje de entrada el condensador no da suficiente de si y durante un breve periodo de tiempo es incapaz de "inyectar" lo que toca y se apagan las luces, eso es el parpadeo que tu tienes.
En definitiva? El regulador con resistencia variable tendría que estar entre el transformador a 12V y los LED, no antes del transformador. (y evidentemnte tendría que tener una resistencia acorde a su situación, no tengo ni idea, pero dudo que sea el mismo tipo)