Primero, mira haber si tu disipador tiene mucha mierda, y le pones pasta termica de la buena (artic silver 5 mismamente), asegurate de que limpias bien el micro y el disipador antes de poner la pasta termica. Yo tengo un gato muy peludo en casa, y la cantidad de pelos que se acumulan es impresionante, asi que asegurate que ese no es tu problema.
Luego, prueba quitandole la tampa lateral, si asi baja bastante la temperatura ya sabes que el problema es de la mala ventilacion de la caja, debido, entre otras cosas por el calor que generan los 2 discos duros.
Salu2