Yo tambien parchee el Parasite Eve 1 para traducirlo al español con el ppf-o-matic3, y no me dio ningun problema, funciono correctamente. La iso la tenia en formato BIN.
Una cosa, te recomiendo que antes de grabar una iso parcheada, la pruebas con un emulador de PSX (EPSXE mejor), asi si esta mal parcheada te ahorrarias tener que tirar un CD a la basura, ya que verias seguramente que en el emulador no funciona.
Para los isos que esten en formato ISO, BIN o NRG, te recomiendo que uses el Nero 6, para las demas usa el Alcohol 120.
Sobre lo ultimo que has dicho, creo que te confundes, no hay version PAL del Parasite Eve 1, del 2 si.
Y no, un parche que se hizo para la version NTSC de un juego no te vale para la version PAL y viceversa.