A ver, lo que es seguro es que esto es un problema de configuración, es imposible que sea por haber flasheado, ya que afecta en el lector, no en el funcionamento del dash ni de la propia configuración de la xbox.
Que utilizas, el media center, o el media connect?
Sea cuál sea prueba a volver a configurar la conexión con el ordenador, a ver si así se soluciona, pero seguro que es problema de configuración.