Ehh bueno, copias y pegas en el ordenador y luego copias y pegas en la tarjeta nueva... no pasa nada de nada... no borres nada ni de la tarjeta vieja ni del ordenador hasta que lo tengas copiado a la nueva y veas que funciona.
Evidentemente, si cambias de flashcart, tendrás que cambiar los saves... hay programas para eso (el propio simply tiene uno, en el cd o en la web). Además, el simply va con roms limpias, por lo tanto, no te servirán tus juegos parcheados para el m3 lite perfect.