De esto ya hay varios hilos por ahi.
De todas formas yo la tengo vertical, se me calienta mucho menos y de momento no se me ha dañado ningún disco, la cuestión es que si tienes un juego funcionando y mueves la consola (esté en vertical u horizontal), esté lo más probable es que se dañe. Para mover la consola aunque sólo sea un poco, mejor cuando ésta esté apagada.