Ok, supongo que lo mejor es empezar desde cero:
1. Instala el Exploit del perfil de NDS
2. Mete el launcher de gateway a la SD, ejecútalo y eliges "Format EmuNAND"
3. Instala el CFW de Palantine, pero no hagas el proceso de la RedNAND (es decir, no hagas los pasos 5,7,8 y 9 del tutorial del CFW). Mete a la raíz de la SD este boot.bin en vez de el de Palantine, te permitirá instalar los CIAs en la NAND sin tener que usar RedNAND. Gracias a Raugo por compartirlo
https://mega.co.nz/#!k00h3KaI!iQiqLgQBm ... 4clKLlKMBI4. Instala DevMenu o BBMenu y después, los CIAs legítimos. Asegúrate de que sean legítimos y de tu región (te recomiendo hacer un backup de la EmuNAND con EmuNANDTool aquí).
5. Ahora vuelve a meter el launcher de Gateway a la SD, sustituyendo el que ya tienes y mete también los archivos del RxTools. Asegúrate de que sea la última versión compatible y vuelve a descargar el firmware.bin y el otro archivo.
6. Inicia RxTools y verifica si te aparecen los CIAs instalados, si alguno no pide FW mayor a 4.5 ya debería iniciar. De todos modos, actualiza la EmuNAND, pero no desde RxTools.
7. Ve al perfil de NDS y en el launcher de Gateway selecciona Boot Classic Mode y presiona X. Te manda a la EmuNAND, ahora ve a ajustes y te deben aparecer las siglas GW 3D 4.5 (o algo parecido). Si es así significa que estás en EmuNAND, asi que ahora ve a la opición de actualizar (necesita internet). Importante que no salgas de ajustes, ya que saldrás de la EmuNAND y podrías actualizar la SysNAND
8. La consola se reinicia, vuelves a la SysNAND, lanzas RxMode y ya debería funcionar todo, además de estar en 9.6. Ten en cuenta que en esta versión de RxTools no funcionan SSB ni MH4.
Eso debería ser todo, intenta hacerlo, suerte!