Hola, lo único que perderias seria la partición del Other OS, es decir todos los datos de los Linux que tivieras antes, pero no pierdes ninguna informacion de la PS3 (Pues me imagino que ya habrás formateado con la PS3 para poder instalarle el Other OS con lo que te divide el disco duro en la particion para la PS3 y la del Other OS, si no lo has echo, cuidado, porque si podrias perder todo)
Salu2