1) Abrir un puerto en tu firewall para acceder a los recursos compartidos (si recuerdo correctamente es el 139)
2) Usar un tunel SSH.
3) Usar una VPN.
El #1 no lo hagas JAMAS, es un grave problema de seguridad, y ademas algunos (muchos) ISP bloquean este puerto tambien por las mismas razones.
El #2 seria una solución medianamente sencilla que requiere un poco de configuración para poder funcionar adecuadamente.
El #3 requiere mas configuración pero seria el mas transparente cuando todo este listo.
Para usar el protocolo smb a traves de internet la #2 y #3 son buenas opciones pero como lo que quieres es acceder a una base de datos en ACCESS, no te recomendaria ninguna de las tres, ya que cualquier problema ya sea en cualquier extremo (ya sea perdida de conexion o una de las maquinas se cuelga) podria corromper la base de datos seriamente (independiente del SO que uses).
Mi consejo es que o migres a un verdadero gestor de BD o mantengas una copia local de la base de datos en la maquina donde va a ser utilizada y sincronizes con tu maquina ubuntu cada cierto tiempo.
P.D.: ni se te ocurra utilizar webdav para acceder a una base de datos en access a traves de internet, corrupción del archivo asegurada.
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