pues veras, si tienes el pen drive en formato WBFS lo unico que podras hacer es utilizarlo para meter ISOs alli, es decir, no podras usarlo como pendrive normal y corriente
lo que si puedes hacer es crear una partición del pen drive, eso lo que hara sera dividirte el pen drive en dos pen drives, y entonces puedes tener una particion en formato WBFS y otra en formato FAT.
eso si, asegurate de que la particion WBFS sea una particion primaria, porque sino la WII no te lo va a reconocer
de todos modos, utiliza el WBFS manager para darle formato WBFS a tu pendrive o particion