¿tienes el firmawe origial del samsung?
Si lo tienes bien extraido no creo que tengas ningun problema en recuperarlo, el problema que te da es por que el flasheo no se ha realizado correctamente, estoy seguro, de todas formas cuando te compres la controladora, lo conectas y lo vuelves a flashear con el firmware modificado, a ver si lo arreglas, lo bueno de los samsung es que los lectores muertos se pueden recuperar sin problemas, si es error del firmware claro, si el lector esta jodido por dentro no hay nada que hacer.
Cuando lo tengas todo prueba y nos comentas como te ha ido.