No todos los animes están basados en manga, uno de los casos más famosos son Evangelion y Cowboy Bebop, que tuvieron su adaptación al manga debido al éxito del anime.
Por cierto, te olvidas de los Manga/Anime-Juego, Juego-Anime/Manga. Algunos animes, aún sin estar basados en manga, no se los sacan de la chistera, sino que se basan en juegos Final Fantasy, Zelda (porque fueron primero los juegos, no? xD), Green Green, Yumeria...