1-Primero, no actualices, porque de momento la M3i Zero aun no es compatible con la ultima versión (1.4), ya sacaran alguna versión compatible, solo tienes que esperar.
2-La gente utiliza Sakura porque es mejor que la version oficial, tiene mas opciones. Me parece que hay una versión que incluye el firm oficial y el sakura. Tu pon el que quiera.
3-Para cargar los juegos es lo mismo, abres la consola, escojes la opción (icono) juego, una vez dentro escojes el juego que quieres y listo.
La M3i Zero también tiene algunas opciones, como el softreset, que sirve para salir del juego y volver al menú sin cerrar la consola. También hay mas opciones, solo has de buscar.