A mi me paso algo similar, al intentar entrar en cualquier carpeta de C, me mortraba otra vez el contenido de C.
Lo que ocurria es que en la config del FashFXP, habia puesto mal la ruta "remote path" para que entrara en "f" directamente.
De todas formas puede ser por cualquier fallo en la configuración bien de la consola o bien del CienteFTP (en mi caso FashFXP), yo crearia de nuevo la conexion en el cliente y revisaria la de la X, y si sigue fallando prueba con otro ClienteFTP....
Ya nos contaras....