A ver. Ya toi aqui otra vez.
Repito otra vez que no se si te he entendido bien lo que quieres hacer asi que si no es eso comentalo.
Lo que pasa es que el Win 9x siempre ha sido un tanto perronerillo ante el tema de tratar con las particiones. Él se intenta instalar en la primera particion FAT que pille. En tu caso solo tienes una particion FAT (la del segundo disco duro) por lo que solo te reconoce esa.
Solucion: Cargarse la particion ext2 o ext3 que hayas instalado con el Mandrake (ya que por lo que he entendido no quieres tener linux en tu ordenador) y crear una nueva particion FAT para el Win.
¿Como?: Crea un disco de arranque para windows. Este disco ha de cargar los controladores del CD (vamos que puedas acceder al CD arrancando desde él). En ese disco copias el format.exe (o .com nunca me acuerdo) y el fdisk.exe Arranca el ordenador con ese disquete de arranque y tecleas:
fdisk
Con esto se abre el gestor de particiones de windows fdisk. Navegando por sus menús cárgate la particion de tipo desconocido del primer disco duro (cuidadin con cargarte la del segundo disco duro que te quedarías sin backups) y crea una nueva particion de tamaño máximo. Sal de fdisk. Tendras que reiniciar. Vuelve a arrancar con el disco de arranque.
Formatea la particion que acabas de crear, entra n el cd de win y reinstala güindous.
P.D. : Si, tb lo puedes hacer con soft libre pero bueno, la verdad es que el fdisk de lin no es el más indicado para hacer particiones de tipo FAT. Por esta vez pasara...
P.D.D. : Yo que tu dejaría un huequecito para mandrake
P.D.D.D : Dá lo mismo el S.O. que uses. Si quieres instalar otro nuevo mejor que preguntes en los foros dedicados al sistema con el que quieres acabar. Seguro que ellos conocen un procedimiento mas sencillo.
P.D.D.D.D : Este servicio técnico no ofrece ninguna garantía así que por favor, si esto no funciona por cualquier causa no lances una manada de abogados sobre mi