Haces dos particiones.
Una pequeñita (la primera) que usara los primeros sectores donde parece se encuentra el problema y que no usaras para nada.
En la segunda particion (que usara los sectores posteriores) deberian quedar los que se encuentran en buen estado.
De todas maneras cuando empiezan a fallar...
Yo tenia un HD Western Digital de 4 TB que me empezo a avisar de sectores erroneos. Recupere toda la informacion. Pense como tu usarlo como segunda copia de seguridad y le añadi un puñado de ficheros. Cuando ya lo tenia preparado para sacarlo y guardarlo de la torre me encuentro que ya no lo reconoce. !! Maldicion !!. Trabajo de horas inutil