Yo he instalado Windows 7 y Ubuntu 9.10 en mi Macbook Pro 13", y es cierto que está más caliente que en Snow Leopard, tranquilamente unos 15º - 20º C a lo mejor (más en Windows que en Ubuntu de todas maneras), pero de ahí a que estropee las CPU´s no me lo creo, ya que hablo que en Snow Leopard suelo estar en el rango 40º - 50º C, y en Windows y Ubuntu, en el rango de 60º - 70º C sino recuerdo mal.
P.D: Yo instalo siempre versiones 64bits.