Para mí el mejor cliente BT en Linux es sin duda KTorrent. Para Gnome, si no tengo instalado todo lo de KDE uso Deluge. Aunque Azureus también me iba muy bien, salvo el consumo de recursos, claro.
El que no me gustó nada fue Transmission. Lo veía demasiado simple. Subí un torrent y no tenía apenas información/control sobre el torrent.
Una pregunta respecto al cortafuegos...
Una vez instalado Ubuntu (en este caso), sin tocar NADA de cortafuegos, viene activado por defecto? Es decir, si tengo los puertos abiertos del router, me daría problemas? O tengo que eliminar iptables (o los que ha dicho coyote más arriba)?