Creo que si un .sis situdado en la raíz de la MMC se instala DESDE EL GESTOR (no usando el FExplorer por ejemplo), no pasa por la memoria interna así que no hay problemas con eso.
Otra forma es usando el UnmakeSIS que lo descomprime en el ordenador y luego sólo hay que pasar las carpetas que te crea el programa.