A si si, a mi me pasó una vez con el smc fan control.
Resulta que, y te lo avisan antes de instalar el programa, necesitas que el ordenador no esté haciendo ninguna tarea que suponga un alto consumo de CPU, mas que nada por que entonces, si en ese momento instalas smcFanControl este da por hecho que la velocidad mínima de los ventiladores es la máxima en ese momento, y entonces se queda siempre en la máxima aun que el programa lo interprete como la mínima...
Desinstalar el programa no me sirvió de nada ya que el hardware ya no hacía caso al programa (no se donde coño se guardan estas preferencias), así que tuve que reinstalar todo el sistema operativo. Fue la única manera de solucionarlo.
Ahora bien, te diré que por defecto las revoluciones por minuto del ventilador de un macbook rondan las 1700-1800 rpm.