Eso es el escalado "nearest neighbor" del renderizador de video, alguna instalación de cualquier tipo relacionado a la reproducción lo cambio a ese modo.
Al usar software independiente como "mpc home cinema" o "vlc" por lo general usan su propia configuración aparte por lo usándolos sales del problema, pero el software restante por lo general seguirá haciendo uso de la configuración del sistema hasta que no la cambies.
Saludos.