El disco duro esta hecho para funcionar en vertical u horizontal, lo que no soporta es cuando lo tienes en angulo pues las mismas cabezas de lectura/escritura rayaran la superficie del disco, claro que esto es cuando esta en funcionamiento.
Si la transportas tan solo asegurate que no se mueva demasiado o se llege a caer y no debe de preocuparte demasiado lo del disco duro pues si bien no encaja perfectamente en la bahia de la consola tampoco esta tan suelto -conseguir un riel para disco duro evita ese pequeño espacio-.
Yo la he llevado en mochila y hay veces que tengo que correr o la dejo en el piso -y ni me fijo si queda en vertical u horizontal, simplemente como quede en el suelo- y hasta se han puedto bailar con la mochila y nada le a pasado, eso si, le pongo una cubierta de hule espuma del empaque de un monitor para que no se golpe y funciona de forma normal.