Brawl confirmado que no, para que funcione deberías editar el juego y hasta ahora nadie ha podido realizar una hazaña tal como que el juego detecte mandos por USB, todo un reto ya que el titulo en su codigo ni siquiera usa cosas por medio de USB y me parece practicamente imposible que suceda.
El equipo de Project M se puso manos a la obra e intento hacer eso, pero dejaron de lado al proyecto en su totalidad y hasta ahora no existe nada.
Ahora, he buscado y la ultima versión de Not64 es del 20 de Abril de este año, no menciona que funcione el Adaptador de GC o el Wii U Pro Controller pero asumo que deberían, si quieres puedo probarlo mañana, o mejor lo intentas tu también, suerte.