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Unlocker (freeware).
una vez instalado, cuando tengas problemas de este tipo, vas al explorador de windows, y le das con el botón derecho sobre la unidad que quieres extraer, y seleccionas "Unlock"
te aparecera una ventana que te indica todos los procesos que tienen ficheros abiertos en la unidad. aquí podrás desbloquearlos (cerrar "a lo bruto" los ficheros abiertos"), o matar los procesos que tienen abiertos estos ficheros.
En principio, si el HD solo lo tienes con el formato WBFS, windows no debería poder acceder a dicha unidad, exceptuando que el proceso del WBFS Manager todavía no esté "muerto"
esto puede suceder, si estas pasando un juego al HD mediante el WBFS manager, y cancelas el proceso cerrando el programa, te quedará un "thread" activo que durará hasta que termine de pasar la iso completa al disco duro. este thread no será visible como ventana, pero como proceso quizas lo puedas encontrar (WBFS_Hermes.exe? o un proceso con un nombre similar?)
Zalu2!