Creo que el software viene en los dos, no es solo para temas de backup, sino también para organizarte música, videos, etc,...
¿por qué es más caro el hdd mac? No tiene explicación. La diferencia entre uno y otro, es que el de mac viene formateado para mac, por tanto no te valdrá en Windows (salvo que te instales el programa para que leea el formato de archivos del mac). Si te compras el HDD de Win2, tendrás que formaterarlo para que tu mac pueda leer y escribir ya que vendrá en ntfs.