Entonces al formatear se comprueban que los archivos a eliminar no estén "marcados" como de sistema... Entonces habría que averiguar como "marcar" los canales duplicados para que se interpreten como un dato prescindible; me explico?
Wanin, tu que ya estas metido en el tema, tal ves te convenga averiguar el tema de archivos comunes y de sistema para lograr un FullDuplicatedChannelRemover