Más o menos. Los pendrives están más diseñados como método de traspaso de datos más que como sistema de almacenamiento masivo. Son muchísimo menos fiables que un disco duro y son más propensos a morir súbitamente sin posibilidad alguna de recuperar los datos. Eso no significa que necesariamente vaya a morir a los dos días pero sí que es cierto que la durabilidad suele ser menor que la de un disco duro físico. Suelen resistir una cantidad máxima de grabaciones, y, cuando ese límite se sucede, suelen morir. Evidentemente, los pendrives de marca suelen durar más que los chinos "guarreros".
En principio, no pasa nada porque uses un pendrive con la WiiU; debería funcionar perfectamente. Ahora bien, debes tener en cuenta lo que comento, un día puede hacer "puf" y te tocará tirarlo a la basura directamente.
