El menu patcher yo lo evitaría... Cuanto menos se manipule lo que viene siendo cosas del sistema y tal, mejor.
Yo recomiendo mejor wad2bin.
https://github.com/DarkMatterCore/wad2bin Es un programa que te los deja preparados en la SD (los deja en la carpeta private / title/ ID del WAD/ content.bin) y lo único que debes hacer es instalar el ticket de los WAD que el programa extrae de ellos para que sean instalables ya que son necesarios que estén en la consola. Además de eso hace faltar tener el IOS del sistema con trucha (si la tienes en 4.3 pues el 80), así ya los puede iniciar desde la SD sin que aparezca el error "no se puede activar este canal". Ojo, esto no hace que se inicien directamente en la SD, aun sigue haciendo falta tener bloques suficientes en la consola.
Y otra opción sería crear una emuNAND con USB Loader GX y metes todos los WAD que quieras sin preocuparse por el espacio ya que eso depende del disco duro.