Pues la caja estara muy mal ventilada o la pasta termica no estará aplicada correctamente, sino huele a que el procesador puede estar defectuoso.
Por si acaso es problema de algo que hayas instalado prueba a comprobar el uso del procesador con algunos programas que usen multihilo a ver si reparte la carga, un solo hilo al 100% puede venir de que este algun proceso monohilo tirando de el al máximo, ademas si has instalado ya cosas tambien puedes probar a hacer una instalación limpia y mirar como se comporta sin nada instalado.
Edito: Y comprueba que los ventiladores esten bien conectados no vaya a haber alguno suelto o alguno que no sea regulable y este siempre al 100% de velocidad.