El juego necesita ser parcheado, supongo, ya que el cartucho original debe usar algun modo especial para guardar partida y el emulador no lo emu, con lo que se supone que pasara lo mismo con n la version EUR y JAP.
Busca en alguna web de GBA un parchador como el Flash Adv Tool, o sino uno que parchee s-ram (en cualquier pagina sobre linkers de GBA los encontraras)