La historia de Final Fantasy Explorers se sitúa en un mundo donde una guerra por las reservas de cristales, la principal fuente de energía del planeta, está a punto de estallar. Para evitarlo, los jugadores deberán unirse y formar un grupo para enfrentarse a las hordas de enemigos y conquistar el recientemente encontrado gran cristal.
Final Fantasy Explorers permite a los jugadores jugar de forma cooperativa junto a sus amigos y dominar más de 20 oficios, entre ellos el de caballero, monje, mago negro o mago blanco, con el objetivo de derrotar a los monstruos. Para facilitar su tarea, los exploradores podrán recurrir al poder de eidolones como Ifrit o Bahamut y también transformarse en otros personajes de la saga Final Fantasy mediante la habilidad de Trance.
