En el año 2047, Tiberium ha cubierto La Tierra (son unos cristales parecidos a las plantas de La Guerra de los Mundos). Nuestro planeta se divide en zonas según el grado de infestación de Tiberium. Las zonas azules prístinas representan el 20% de la superficie del planeta y son el refugio pasado del mundo civilizado. Las zonas amarillas parcialmente habitables representan el 50% de la superficie del planeta; la mayoría de la población del mundo se encuentra en estas áreas ya que el 30% restante es inhabitable, es una tierra de Tiberium barrida por las violentas Tormentas de Iones. Las zonas rojas son como la superficie de un planeta alienígena.
Por su parte, Kane y la Hermandad de NOD pretenden un asalto masivo frente a la GDI (Global Defense Initiative) y a las pocas zonas restantes del planeta.
