Bueno, hoy he estado entretenido a ver que sacaba, os explico.
He sacado el lector y lo he revisado por si al hacer el proceso de extracción de key se hubiera roto algo, aparentemente parece que no es cosa de hardware.
Al tenerlo quitado me he dado cuenta que la consola marcaba en pantalla como abriendo (aún sin estar el lector conectado) si pulsaba el botón de expulsar salia cerrando he inmediatamente abriendo quedandose en ese estado, viendo esto he llegado a la conclusión que es un problema de la consola, es posible que en el transcurso del flasheo la consola detectó un problema en el lector y se quedo constantemente enviando la información de expulsión de la unidad.
El outro ata reset no ha funcionado y he intentado diversas combinaciones con la lectora para intentar dejarla de nuevo en el estdo correcto, no ha servido de nada.
Los animos decaen y ya lo veo muy complicado solucionar el tema, creo que lo único que me queda es probar en el SAT, esperemos que no se den cuenta.
Una pena Thenoxus por que soy de Barcelona si no haciamos una quedada.