Yo no he probado un multidisco con la cobra 1.5 o 1.6 pero con la 1.2 me iba muy bien, con todos los juegos. Comprueba que tienes los cables azules correctamente puestos en el sensor de la tapa, si no lo has instalado tu y lo han puesto en alguna tienda, quizas hayan pasado de ponerlos
EDITO: la Gcos 1.5 no tiene soporte multidisco, si tienes viper, con la cobra funciona, con el qoob, su propia bios tambien funciona y si estas usando el metodo AR+SD o similar, como bien decian la Gcos 2.0 beta dicen que lo soporta, pero no lo he probado