Para windows creo que habia un programa llamavo speed disk que te dice la velocidad de transferencia
Para linux, (al menos en KDE) cuando copias un archivo te dice la velocidad a la que se transfieren los datos.
Otra opcion seria transferir un archivo y aplicar la siguiente formula
tamaño del archivo/tiempo empleado=velocidad de transferencia
Lo mas seguro es que la velocidad la de en bytes al segundo (KB, MB...)
Tienes que tener en cuenta que la velocidad del USB es de 480Mb (megabits) al segundo entonces 480Mb/8=60MB/s
Lo de transferir el archivo, el pendriva deberia estar vacio y probarlo con un archivo bastante grande
Espero haerte ayudado
Un saludo