pues la verdad...habiendolas visto todas esas que mencionas (y las demás también), es difícil resumir en qué se diferencian, por que sinceramente es básicamente en todo
desde el dibujo, diseño de personajes o ritmo narrativo hasta el estilo de animación (en este último por ejemplo se suele hacer referencia a que miyazaki suele triunfar por tener un estilo mas 'occidental', mas trabajado y menos 'limitado' que la animacion japonesa comun, por otro lado otomo y en concreto akira su triunfo, sobre todo en occidente fue por su dureza, tratandose de dibujos, ya que aqui nunca se habia visto una animacion tan adulta antes).
Yo te recomendaría que leyeses algunos de los muchos libros, revistas o monografías que hay sobre los dos autores y sobre Ghibli (aunque eso si, la mayoria estan en ingles), yo tengo bastantes de ellos y creo que te ayudaran bastante. Recuerda: internet es tu amigo. Podras encontrar libros en muchas tiendas online. Si quieres que de algun titulo dilo y podría mirar algunos de los que tengo (pero vamos, se encuentran facilmente)