A ver, que a mi me ha pasado una cosa que estoy leyendo que os pasa a mas...
Cuando tengais el FLIP de Atmel instalado, y seleciones el chip que es, le deis a abrir la conexión y tal, en la columna de la izquierda marcais TODAS las casilla, y luego le das al Run de debajo.
No se quien dijo que habia que darle a Start aplication pero eso no funciona.
(Si usais el BM modificado, y el PSGroove de Hermes, cuando le deis al app_home y tal arranca el juego, si esperais sale el logo del juego y tal, si no arrancais el BM, arranca el BluRay que tengais...)