Imagino que es un problema por el dock. Has probado a conectarlo directamente a ver si te hace lo mismo?
A mí me pasó con un dock que necesitaba fuente de alimentación. Cuando se ponía en reposo y volvía, no era capaz de acceder a los dispositivos que tuviera conectados al dock, fueran los que fuera.
Respecto al formato, mejor MacOsPlus porque vas a conseguir mejor rendimiento de lectura y escritura que ExFat, más allá de las compatibilidades que te han comentado.
Un saludo.