El sistema de archivos nada tiene que ver con el sistema de television empleado. Si tu disco duro es multimedia se refiere a que el mismo gabinete tiene las salidas para conectarse a la entrada de video de un televisor convencional -video compuesto [RCA color amarillo] o componentes de video [RCA rojo, azul y verde] o S-Video- como cualquier reproductor VHS o DVD.
Lo que es cierto es que reproductores de DVD con puerto USB para discos externos en muchos casos no aceptan el sistema de archivos NTFS y usan solo FAT16/FAT32.