Puede ser, eso depende de como lo tengo implementado el fabricante de la placa base.
De todos modos, tendría que ser una gráfica que ocupe más de 2 slots para que chocara, ten cuidado con eso y no tendrás problemas, sino tendrías que haberte comprado otra placa base que tuviera más slots, ahora ya es tarde...
Saludos.