yo directamente me guardo los saves en el pc con un copy paste, y luego al restaurarlo va bien.
Lo que tengo entendido es que los saves de un juego USA/JAP no vales para un juego EUR, por todo lo demas sólo necesitas que el save i la rom tengan el mismo nombre, salvo la extension, claro(juego1.sav es el savegame de juego1.nds)
No se si me he explicado con claridad, pero weno... un saludo!