Bueno, de hecho el PCSX2 está licenciado bajo GNU GPL v2, si no está en Linux es porque su principal plugin gráfico está escrito para Direct3D. Pero se está trabajando en un plugin bajo OpenGL que permitirá su funcionamiento bajo Linux.
Además por lo que parece pronto habrá versión para 64 bits del emulador y esperan que eso incremente la velocidad (acerca de lo cual tengo mis dudas, los 64 bits sólo son más rápidos en condiciones muy específicas).