no el pciex 1. solo tiene un ancho de banda de 2.5 gbps
te digo por que tengo una placa similar y también otra con sata 3 con el mismo problema
la única solución para que te de ese hancho de banda de 5gbps es que la conectes a un pciex de los grandes no a las 1X
en esos que son para graficas hay lo conectas y tendras todo el hancho de banda del pciex y por supuesto de los usb3
ahora otra cosa realmente necesitas un usb3?
el disco duro externo es usb3? por que sino no va a haber diferencia
yo tengo un disco duro externo para la Xbox 360 y suelen pasar los juegos bastante rápido sobre uno 24 Mb continuos
en 3 o 4 o asi ya esta el juego copiado en el disco
saludos