Despues de mucho buscar, lo unico que encontre fue un ripkit que quitaba los videos duplicados y los japoneses. Pero como a mi me gustan mas los videos en japones probé a hacer lo mismo pero quitando los americanos. Y el resultado es una iso de solo 3,88GB funcionando perfectamente.
1) Se crea la iso con el DVD Decrypter
2) Con el Apache extraemos las dos capas del juego en directorios distintos (Ej: C:\GENJI\LAYER0 y C:\GENJI\LAYER1)
3) Movemos las carpetas y los archivos del directorio LAYER1 al LAYER0 (Si el directorio ya existe solo copiamos los archivos que contenga el directorio de LAYER1 a LAYER0). Despues ya podemos borrar el LAYER1
4) Ahora todos los archivos tienen que ocupar 7,28GB
5) Borramos los directorios MV_UN y MV_UP
6) Despues borramos del directorio MV_JP todos los archivos que esten repetidos en el directorio MOVIE
7) Despues montar con el CD/DVD Generator la iso y ya esta. En 3,88 GB las peliculas con audio en japones sin necesidad de comprimir nada.
Nota: A lo mejor se podría eliminar alguna peli duplicada mas pero no he querido arriesgarme y además ya cabe de sobra en un DVD-5.
Bueno, espero que haya podido ayudar a alguien.
Un saludo y seguid asi con el foro que es de puta madre.